地球物理学家YusukeTiansuo博士（KatsukiKobayashi）带领他的团队进行了一次深海科学考察，但在海底发现了异常的裂缝和泥石流。经过一系列调查，他得出日本群岛即将下沉的结论。但是，日本政府官员认为，坦索博士的预言是难以置信的谎言。只有山本首相（由石坂浩二饰演）认识到了这种情况的严重性，并任命了天正的前妻高森沙织孝（MaoTei饰）担任危机管理大臣，领导丹男博士及其团队努力拯救日本。从北海道开始，不久就在日本诸岛发生了大规模的地质灾害，整个日本陷入了恐慌。政府对灾难不知所措，唯一的海外移民政策完全无法应对急剧恶化的情况。日本诸岛完全沉没的现实即将发生。最终，田中博士和他的团队成员终于找到了拯救日本的方法，但是这种方法的实际操作非常困难……这部电影改编自日本科幻小说最畅销的同名小说。小说家小松酒京这部电影耗资201亿日元，是近年来日本电影业投资最大，宣传力度最大的灾难电影。