恐龙从索纳岛逃逸已经过去了八年，而艾伦·格兰特博士（萨姆·尼尔）仍然不想回到那个幽灵之地。尽管他发了沉重的誓言，但现状却使他撤回了誓言。他的一项史前动物研究陷入了资金短缺的困境。这时，富有的商人保罗·布莱恩特（WilliamH.Macy）和他的妻子阿曼达（TéaLeoni）找到了埃伦，并邀请他作为向导带他们去索纳岛观光。一方面，他得到了丰厚的回报。另一方面，他了解到不需要在岛上着陆，而艾伦在治愈伤疤后忘记了痛苦，就接受了他们的邀请。但是事情朝相反的方向发展，他们的飞机终于在岛上紧急降落。只有到那时，他才知道原来的神户夫妇来到这里寻找他们失踪的儿子。同时，他还发现，经过八年的自然进化，最聪明的恐龙迅猛龙（Velociraptor）有了一种可以交流的语言。这次他的对手不仅凶悍，而且更加狡猾。