杀死并淹没的罪犯神秘地死了。人们认为惩罚在天上道路上邪恶的基拉是救世主，而警察却束手无策。专门解决奇怪事件的天才L推断，基拉有97％的机率在日本，因此他离开了洛杉矶，飞往日本。临走之前，L的心中隐隐有一种预感，他可能永远也不会回来。L和Kira-YeShenyue开始了正面对抗。这时，泰国的一个小村庄被从地面上抹去了。L不知道可能正在破坏世界的重​​大阴谋正在酝酿中。