影片叙述了在一个时局骚动，军阀割据的时代，大众生灵涂炭，坊间谣传诡门十三针是一种奇特的针法，可以医治各种疑难杂症，主人公赤瞳从小便是孤儿，爸爸妈妈便是被阴病所害，在与苏哮天结识之后，踏上了用诡门十三针医治阴病的旅程，阅历了一番困难的奋斗之后，苏哮天在与阴病的战役中，不幸离世，赤瞳承继了苏哮天的毅力，踏上了根除阴病的路程……红的吓人