1945年，游学归来的刑侦专家程慈航，在码头遭受险情，多方实力为抢夺一只铁箱大开杀戒。这只铁箱里，存放着日军细菌武器的绝密档案。差人厅厅长莫采石将铁箱存放在了档案馆密室内，却在夜里档案被盗，案情从此错综复杂。程慈航得悉此案事关日军细菌武器，向“叔叔”莫采石请战，总署刑侦差人局局长霍然随即特聘程慈航为布衣侦察。程慈航就任后，很快找到蛛丝马迹，顺藤摸瓜连续捕获严重头绪，但是他却处处受阻，总有人抢先一步将相关人员杀人灭口，暗地黑手终究是谁？这个丢掉的档案又终究在哪里？程慈航终究怎么破解迷局，全部尽在答案尽在《昙花梦》里。